Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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