Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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