Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms