Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ric1Q69ZJ7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms