Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80dQ66JY2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms