Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PatjQ63ZW7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms