Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms