Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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