Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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