Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhocQ62159 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhocQ62159 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms