Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms