Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms