Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sim1Q61045 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sim1Q61045 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms