Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms