Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms