Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms