Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rbm27Q5SFM8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rbm27Q5SFM8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rbm27Q5SFM8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm27Q5SFM8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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