Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C4

Vps13a, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 3,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13aQ5H8C4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13aQ5H8C4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms