Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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