Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms