Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Snhg11Q4G0K9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Snhg11Q4G0K9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Snhg11Q4G0K9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Snhg11Q4G0K9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Snhg11Q4G0K9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snhg11Q4G0K9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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