Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms