Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms