Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr7Q3V0I2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms