Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3V0E1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms