Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms