Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms