Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp560Q3URI6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp560Q3URI6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms