Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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