Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms