Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rmdn3Q3UJU9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms