Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms