Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hvcn1Q3U2S8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms