Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TQQ9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms