Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms