Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccbe1Q3MI99 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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