Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tdrd9Q14BI7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd9Q14BI7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms