Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms