Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms