Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms