Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CbfbQ08024 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms