Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms