Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms