Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Hivep1Q03172 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms