Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcqQ02111 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms