Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms