Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms