Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms