Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms