Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabpaQ00422 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms